Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNK9Q9NPC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK9Q9NPC2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNK9Q9NPC2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK9Q9NPC2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms