Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRM3Q9NNZ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRM3Q9NNZ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRM3Q9NNZ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRM3Q9NNZ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms