Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUFT1Q9NNX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUFT1Q9NNX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TUFT1Q9NNX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUFT1Q9NNX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms