Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C5orf42Q9H799 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C5orf42Q9H799 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C5orf42Q9H799 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C5orf42Q9H799 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms