Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MIXL1Q9H2W2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MIXL1Q9H2W2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MIXL1Q9H2W2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms