Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMES1Q9C002 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMES1Q9C002 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NMES1Q9C002 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms