Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NMES1Q9C002 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NMES1Q9C002 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NMES1Q9C002 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NMES1Q9C002 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NMES1Q9C002 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NMES1Q9C002 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NMES1Q9C002 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NMES1Q9C002 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NMES1Q9C002 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NMES1Q9C002 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NMES1Q9C002 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NMES1Q9C002 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NMES1Q9C002 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NMES1Q9C002 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NMES1Q9C002 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NMES1Q9C002 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NMES1Q9C002 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NMES1Q9C002 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NMES1Q9C002 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NMES1Q9C002 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NMES1Q9C002 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NMES1Q9C002 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NMES1Q9C002 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NMES1Q9C002 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NMES1Q9C002 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NMES1Q9C002 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NMES1Q9C002 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NMES1Q9C002 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NMES1Q9C002 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NMES1Q9C002 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NMES1Q9C002 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NMES1Q9C002 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NMES1Q9C002 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NMES1Q9C002 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NMES1Q9C002 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NMES1Q9C002 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NMES1Q9C002 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NMES1Q9C002 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NMES1Q9C002 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NMES1Q9C002 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NMES1Q9C002 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NMES1Q9C002 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NMES1Q9C002 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NMES1Q9C002 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NMES1Q9C002 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMES1Q9C002 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NMES1Q9C002 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMES1Q9C002 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NMES1Q9C002 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NMES1Q9C002 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NMES1Q9C002 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMES1Q9C002 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NMES1Q9C002 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NMES1Q9C002 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NMES1Q9C002 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NMES1Q9C002 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NMES1Q9C002 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NMES1Q9C002 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NMES1Q9C002 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NMES1Q9C002 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NMES1Q9C002 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMES1Q9C002 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NMES1Q9C002 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NMES1Q9C002 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NMES1Q9C002 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NMES1Q9C002 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NMES1Q9C002 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NMES1Q9C002 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NMES1Q9C002 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NMES1Q9C002 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NMES1Q9C002 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMES1Q9C002 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMES1Q9C002 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMES1Q9C002 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMES1Q9C002 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NMES1Q9C002 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMES1Q9C002 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NMES1Q9C002 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NMES1Q9C002 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms