Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FUNDC2Q9BWH2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FUNDC2Q9BWH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FUNDC2Q9BWH2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms