Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC17Q9BRA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TXNDC17Q9BRA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TXNDC17Q9BRA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TXNDC17Q9BRA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms