Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRRC7Q96NW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC7Q96NW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC7Q96NW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC7Q96NW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC7Q96NW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms