Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUS1Q96E22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUS1Q96E22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUS1Q96E22 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUS1Q96E22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms