Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYTL4Q96C24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SYTL4Q96C24 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYTL4Q96C24 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SYTL4Q96C24 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYTL4Q96C24 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYTL4Q96C24 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYTL4Q96C24 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYTL4Q96C24 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SYTL4Q96C24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYTL4Q96C24 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms