Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM143Q96AN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM143Q96AN5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM143Q96AN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM143Q96AN5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms