Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC17Q96AE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC17Q96AE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TTC17Q96AE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC17Q96AE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms