Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD6Q92537 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD6Q92537 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD6Q92537 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD6Q92537 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD6Q92537 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUSD6Q92537 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUSD6Q92537 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms