Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAT3Q8TDW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAT3Q8TDW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms