Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU7

TET1, Methylcytosine dioxygenase TET1, humanhuman

Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET1Q8NFU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TET1Q8NFU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TET1Q8NFU7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TET1Q8NFU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TET1Q8NFU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms