Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHCHD4Q8N4Q1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHCHD4Q8N4Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHCHD4Q8N4Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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