Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms