Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD3Q86TU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD3Q86TU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD3Q86TU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD3Q86TU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD3Q86TU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms