Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP2Q7RTS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP2Q7RTS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTOP2Q7RTS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTOP2Q7RTS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTOP2Q7RTS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OTOP2Q7RTS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTOP2Q7RTS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTOP2Q7RTS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP2Q7RTS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms