Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLRC3Q7RTR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC3Q7RTR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms