Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6Q795 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6Q795 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6Q795 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6Q795 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6Q795 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6Q795 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6Q795 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6Q795 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6Q795 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6Q795 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6Q795 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6Q795 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6Q795 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6Q795 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6Q795 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6Q795 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6Q795 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6Q795 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q6Q795 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6Q795 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6Q795 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6Q795 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6Q795 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q6Q795 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q6Q795 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q6Q795 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms