Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF544Q6NX49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF544Q6NX49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF544Q6NX49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms