Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALS2CLQ60I27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALS2CLQ60I27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALS2CLQ60I27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms