Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC23Q5W5X9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23Q5W5X9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC23Q5W5X9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC23Q5W5X9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms