Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND4CQ5VZ89 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND4CQ5VZ89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND4CQ5VZ89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND4CQ5VZ89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms