Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
RSPH4AQ5TD94 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RSPH4AQ5TD94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RSPH4AQ5TD94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
RSPH4AQ5TD94 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RSPH4AQ5TD94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RSPH4AQ5TD94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RSPH4AQ5TD94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RSPH4AQ5TD94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms