Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1JQ5JR12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1JQ5JR12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1JQ5JR12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1JQ5JR12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms