Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABRA6Q16445 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRA6Q16445 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA6Q16445 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABRA6Q16445 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms