Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDC1Q14676 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDC1Q14676 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDC1Q14676 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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