Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 22
PUM1Q14671 THOC2-207ENST00000438358 1137 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-9■■■■□ 22
PUM1Q14671 THOC2-212ENST00000464161 660 ntTSL 23.68□□□□□ -1.821e-9■■■■□ 22
PUM1Q14671 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-7■■■■□ 21.9
PUM1Q14671 PKN1-207ENST00000586557 899 ntTSL 521.95■■□□□ 1.11e-8■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PKN1-204ENST00000585839 3518 ntTSL 217.64■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-207ENST00000462188 1735 ntTSL 215.38■□□□□ 0.059e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.19e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.189e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.529e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 29.32□□□□□ -0.929e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.959e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.149e-10■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-210ENST00000490173 641 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 DAXX-208ENST00000477162 847 ntTSL 58.09□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 21.8
PUM1Q14671 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt24.03■■□□□ 1.442e-7■■■■□ 21.7
PUM1Q14671 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 212.42□□□□□ -0.426e-8■■■■□ 21.6
PUM1Q14671 FAF1-203ENST00000472808 759 ntTSL 35.49□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 21.6
PUM1Q14671 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 21.5
PUM1Q14671 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 21.5
PUM1Q14671 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 214.8□□□□□ -0.042e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.22e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-9■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 SMC1A-204ENST00000463684 880 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-13■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 SMC1A-203ENST00000428014 868 ntTSL 39.41□□□□□ -0.91e-13■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 310.73□□□□□ -0.697e-7■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.437e-7■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 CDC37-205ENST00000589625 587 ntTSL 214.71□□□□□ -0.056e-10■■■■□ 21.4
PUM1Q14671 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 519.32■□□□□ 0.688e-8■■■■□ 21.3
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PUM1Q14671 SETD2-201ENST00000330022 8172 ntTSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 SETD2-204ENST00000431180 7555 ntTSL 25.57□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 SETD2-205ENST00000445387 7075 ntTSL 54.19□□□□□ -1.744e-6■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.326e-7■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 21.3
PUM1Q14671 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-7■■■■□ 21.2
PUM1Q14671 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.07■□□□□ 03e-11■■■■□ 21.2
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PUM1Q14671 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.435e-7■■■■□ 21.2
PUM1Q14671 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 37.18□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 21.2
PUM1Q14671 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.147e-8■■■■□ 21.2
PUM1Q14671 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)23.7■■□□□ 1.383e-6■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 523.37■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-9■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 21.1
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PUM1Q14671 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 21.1
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PUM1Q14671 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-9■■■■□ 21.1
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PUM1Q14671 CFAP36-202ENST00000349456 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-9■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 513.62□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 313.44□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 21.1
PUM1Q14671 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 520.75■□□□□ 0.916e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 320.22■□□□□ 0.836e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 212.98□□□□□ -0.336e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 217.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-13■■■■□ 21
PUM1Q14671 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.721e-13■■■■□ 21
PUM1Q14671 SP3-207ENST00000490182 459 ntTSL 418.83■□□□□ 0.62e-9■■■■□ 21
PUM1Q14671 SP3-204ENST00000462904 535 ntTSL 412.34□□□□□ -0.432e-9■■■■□ 21
PUM1Q14671 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-9■■■■□ 21
PUM1Q14671 SP3-202ENST00000416195 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.642e-9■■■■□ 21
PUM1Q14671 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 416.52■□□□□ 0.247e-11■■■■□ 21
PUM1Q14671 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 519.17■□□□□ 0.662e-8■■■■□ 21
PUM1Q14671 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-8■■■■□ 21
PUM1Q14671 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.848e-8■■■■□ 21
PUM1Q14671 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 21
PUM1Q14671 CAST-225ENST00000509259 565 ntTSL 49.11□□□□□ -0.952e-10■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 HUWE1-201ENST00000218328 5488 ntTSL 517.33■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 IQGAP1-216ENST00000561132 601 ntTSL 410.62□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 IQGAP1-205ENST00000559031 583 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-7■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 313.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 20.9
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