Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CKAP5Q14008 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CKAP5Q14008 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP5Q14008 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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