Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms