Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE2V1Q13404 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms