Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P3Q13401 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P3Q13401 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P3Q13401 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMS2P3Q13401 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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