Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO1EQ12965 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1EQ12965 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1EQ12965 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1EQ12965 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1EQ12965 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms