Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFF2Q03403 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFF2Q03403 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFF2Q03403 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms