Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB4BP68371 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBB4BP68371 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4BP68371 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms