Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS28P62857 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS28P62857 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS28P62857 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS28P62857 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS28P62857 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS28P62857 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS28P62857 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS28P62857 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS28P62857 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS28P62857 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS28P62857 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS28P62857 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS28P62857 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS28P62857 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS28P62857 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS28P62857 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS28P62857 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS28P62857 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS28P62857 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPS28P62857 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPS28P62857 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS28P62857 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPS28P62857 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPS28P62857 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPS28P62857 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPS28P62857 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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