Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23P62829 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23P62829 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23P62829 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23P62829 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL23P62829 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL23P62829 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23P62829 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23P62829 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23P62829 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23P62829 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23P62829 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23P62829 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23P62829 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23P62829 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23P62829 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23P62829 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23P62829 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23P62829 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23P62829 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23P62829 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23P62829 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23P62829 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23P62829 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23P62829 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23P62829 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23P62829 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23P62829 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23P62829 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23P62829 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23P62829 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23P62829 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL23P62829 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL23P62829 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL23P62829 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL23P62829 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL23P62829 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms