Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCD1P59942 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCCD1P59942 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCCD1P59942 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms