Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EIF3BP55884 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF3BP55884 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3BP55884 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF3BP55884 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms