Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRX1P54821 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRX1P54821 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRX1P54821 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms