Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2D1P51668 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBE2D1P51668 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBE2D1P51668 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms