Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB28P51157 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB28P51157 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB28P51157 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB28P51157 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB28P51157 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB28P51157 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB28P51157 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB28P51157 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB28P51157 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB28P51157 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB28P51157 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB28P51157 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB28P51157 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB28P51157 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB28P51157 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB28P51157 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB28P51157 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB28P51157 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB28P51157 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB28P51157 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB28P51157 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB28P51157 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB28P51157 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB28P51157 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB28P51157 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB28P51157 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB28P51157 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB28P51157 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB28P51157 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB28P51157 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB28P51157 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB28P51157 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB28P51157 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB28P51157 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB28P51157 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB28P51157 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB28P51157 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB28P51157 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB28P51157 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB28P51157 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB28P51157 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB28P51157 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB28P51157 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB28P51157 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB28P51157 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB28P51157 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB28P51157 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB28P51157 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB28P51157 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms