Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 IFT46-202ENST00000264021 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NCKAP1L-208ENST00000552211 597 ntTSL 511.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-210ENST00000556675 771 ntTSL 311.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 411.03□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-211ENST00000502724 541 ntTSL 410.99□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP006222.1-204ENST00000634344 1554 ntTSL 510.93□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-208ENST00000593268 552 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-209ENST00000490265 4259 ntTSL 210.87□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 210.83□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-212ENST00000502727 582 ntTSL 410.83□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-202ENST00000376763 1464 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-206ENST00000471994 769 ntTSL 510.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CPSF4-213ENST00000484112 825 ntTSL 210.76□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MSH5-213ENST00000468136 690 ntTSL 210.74□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-208ENST00000566718 3439 ntTSL 210.65□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-215ENST00000611884 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-201ENST00000295930 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-207ENST00000518397 830 ntTSL 510.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-208ENST00000531201 1496 ntTSL 210.36□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-211ENST00000428369 751 ntTSL 210.36□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 410.29□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP006222.1-206ENST00000424587 5603 ntTSL 510.15□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-210ENST00000480119 1335 ntTSL 510.15□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-206ENST00000554799 821 ntTSL 510.12□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.89e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 29.99□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01376-203ENST00000432142 571 ntTSL 49.98□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-207ENST00000549682 596 ntTSL 49.91□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZNF283-205ENST00000590950 466 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CHD9-219ENST00000569225 1862 ntTSL 29.81□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 59.73□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-205ENST00000471911 931 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-212ENST00000472705 1212 ntTSL 29.57□□□□□ -0.889e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RABGAP1L-219ENST00000526253 439 ntTSL 59.31□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-213ENST00000551407 544 ntTSL 49.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-203ENST00000547604 276 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-218ENST00000636748 8853 ntTSL 29.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-235ENST00000638000 1401 ntTSL 59.24□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01376-201ENST00000418165 553 ntTSL 49.1□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRR16-205ENST00000509923 559 ntTSL 39.04□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-201ENST00000264020 1819 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MANBA-207ENST00000514430 7444 ntTSL 28.94□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GNPTAB-210ENST00000552681 2267 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.91□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-210ENST00000418055 568 ntTSL 58.69□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PCDH9-205ENST00000614931 461 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 61.8
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