Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HCAR3P49019 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCAR3P49019 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCAR3P49019 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms