Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABIFP47224 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABIFP47224 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABIFP47224 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABIFP47224 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABIFP47224 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABIFP47224 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABIFP47224 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABIFP47224 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABIFP47224 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABIFP47224 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RABIFP47224 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABIFP47224 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABIFP47224 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABIFP47224 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABIFP47224 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABIFP47224 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABIFP47224 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RABIFP47224 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABIFP47224 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABIFP47224 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABIFP47224 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABIFP47224 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABIFP47224 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABIFP47224 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABIFP47224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABIFP47224 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABIFP47224 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RABIFP47224 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABIFP47224 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABIFP47224 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABIFP47224 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABIFP47224 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABIFP47224 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABIFP47224 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABIFP47224 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABIFP47224 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABIFP47224 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABIFP47224 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABIFP47224 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABIFP47224 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABIFP47224 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABIFP47224 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABIFP47224 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RABIFP47224 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABIFP47224 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABIFP47224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABIFP47224 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABIFP47224 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABIFP47224 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABIFP47224 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms