Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDH1P40925 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDH1P40925 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDH1P40925 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDH1P40925 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDH1P40925 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDH1P40925 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDH1P40925 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDH1P40925 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDH1P40925 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDH1P40925 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDH1P40925 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDH1P40925 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDH1P40925 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDH1P40925 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDH1P40925 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDH1P40925 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDH1P40925 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDH1P40925 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDH1P40925 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDH1P40925 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDH1P40925 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDH1P40925 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDH1P40925 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDH1P40925 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDH1P40925 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDH1P40925 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDH1P40925 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDH1P40925 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MDH1P40925 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDH1P40925 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDH1P40925 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDH1P40925 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms